Auch im dritten Jahr gehört die Bekämpfung von Dämonen weiterhin zum Alltagsgeschäft der Halliwells, jedoch bekommen sie es mit einem Höllenwesen zu tun, das zunächst keines zu sein scheint. Die Triade - eine Vereinigung von mächtigen Dämonen - schickt den Halbdämon Balthasar los, um die Schwestern zu töten. Diese sind natürlich vollkommen ahnungslos mit wem sie es da zu tun bekommen. Balthasar, der zur Hälfte Mensch ist, nimmt die Gestalt von Cole Turner an und arbeitet als Vertreter des Bezirksstaatsanwalts. Und genau in diesen verliebt sich Phoebe. Nach und nach findet sie heraus, dass Cole in Wahrheit Balthasar ist. Doch auch für Balthasar hat sich einiges verändert: Seine menschliche Hälfte Cole hat inzwischen wahre Gefühlen für Phoebe entwickelt, was ihn in ein Dilemma bringt: Seine Verpflichtung gegenüber der Triade und der Quelle - Herrscher der Unterwelt - gegen seine Liebe für Phoebe. Piper und Leo hingegen schaffen es nach einem fehlgeschlagenen Versuch zu heiraten und sogar den Segen des Ältestenrats der Wächter des Lichts für ihre Verbindung zu erhalten. Die Triade plant unterdessen Balthasar zu töten, da er ihnen nicht länger loyal ist, doch dieser Plan scheitert. Cole kommt ihnen zuvor und tötet die Triade. Der Nachteil: Nun sind alle möglichen Kopfgeldjäger hinter ihm her - ausgesandt von der Quelle. Weitere Veränderungen finden statt: Phoebe und Piper haben inzwischen neue Fähigkeiten bekommen: Phoebe beherrscht nun die Levitation (schweben) und Piper die molekulare Beschleunigung (explodieren). Zum Ende der Staffel, in deren Verlauf sich die Geschichte um Cole und Phoebe immer mehr zugespitzt hatte, werden die Schwestern als Hexen enttarnt und die Öffentlichkeit flippt geradezu aus. Als eine verrückte Möchtegernhexe Piper im Manor anschiesst und diese kurze Zeit später im Krankenhaus stirbt, gehen die Schwestern einen Deal mit dem Bösen ein. Die Zeit wird zurückgedreht, doch Phoebe muss für Pipers Leben in der Unterwelt bleiben. Pipers Tod und die Entdeckung der Halliwells werden rückgängig gemacht, doch das reicht nicht: Der Dämon Shax greift Piper und Prue im Manor an und tötet Prue. Piper kann durch Leo gerade noch gerettet werden. Und so ist zum Ende der dritten Staffel die Macht der Drei zerbrochen. Leo und Cole gelingt es Phoebe und sich selbst aus der Unterwelt zu befreien, doch für Prue gibt es keine Rettung mehr. Piper und Phoebe sind am Boden zerstört, doch alle Hexenmacht hilft nichts. Sie können Prue nicht wiedererwecken.